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成像,图像分析和数据可视化

汉川彭编辑的部分

本节包括成像和生物图像信息的所有方面,包括但不限于:图像分析和相关机器学习的微观和生物医学图像采集方法和应用,方法和应用,图案识别和数据挖掘技术,以图像为导向的多维数据和元数据BioImage注释和本体生成的可视化技术,方法和应用。

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  1. 表达式H-SAPIENS.谈到社交沟通时发挥着显着作用。人类的鉴定是相对容易和准确的。但是,实现了相同的结果......

    作者:Olalekan Agbolade, Azree Nazri, Razali Yaakob, Abdul Azim Ghani和Yoke Kqueen Cheah

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:619

    内容类型:研究文章

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  2. 细胞核或细胞检测是显微镜图像分析的一项基本任务,并支持许多其他定量研究,如目标计数、分割、跟踪等。深度神经网络正在兴起…

    作者:邢福勇,谢元普,史晓双,陈平军,张紫昭,杨林

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 472

    内容类型:研究文章

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    本文更正已发表于此欧宝娱乐合法吗2019年20.:509

  3. 了解蜂窝体系结构是各种生物学研究的基本问题。C. Elegans.由于其独特的命运决定,在这些研究中被广泛用作模式生物。最近……

    作者:建锋曹,明基黄,中盈赵和洪燕

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 176

    内容类型:方法文章

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  4. 骨骼肌细胞图像的快速和准确的自动分割对于诊断肌肉相关疾病的诊断至关重要,这极大地减少了劳动密集型手动注释。最近,几个......

    作者:崔磊,冯军,张紫昭,杨林

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 158

    内容类型:方法文章

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  5. 3D图像的分割是一项可能在某些情况下几乎可以自动化的任务,特别是当对比度低并且元件之间的距离小时时。现有的监督方法重新...

    作者:巴斯蒂安·科瓦奇,Jérôme菲润巴赫,吕蒂文·纪尧姆和皮埃尔·韦斯

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 142

    内容类型:软件

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  6. 高通量测序通常为生命科学中的实验分析提供基础。对于许多这样的方法,生物信息数据分析的中间层是基因组信号轨道c…

    作者:Artyom A. Egorov,Ekaterina A. Sakharova,Aleksandra S. Anisimova,Sergey E. Dmitriev,Vadim N. Gladyshev和Ivan V.Kulakovskiy

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 113

    内容类型:软件

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  7. 生物医学文献正在以不断增长的速度扩展,对于研究人员来说,即使在他们自己的专业领域中,研究人员也会变得非常挑战。我们......

    作者:Patricia Maraver,RubénAmañanzas,托德A. Gillette和Giorgio A. Ascoli

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 50

    内容类型:软件

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  8. 我们介绍了BPG,一个在R统计环境中生成发布质量、高度自定义图的框架。

    作者:Christine P’ng, Jeffrey Green, Lauren C. Chong, Daryl Waggott, Stephenie D. Prokopec, Mehrdad Shamsi, Francis Nguyen, Denise Y. F. Mak, Felix Lam, Marco A. Albuquerque, Ying Wu, Esther H. Jung, Maud H. W. Starmans, Michelle A. Chan-Seng-Yue, Cindy Q. Yao, Bianca Liang…

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 42

    内容类型:软件

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  9. 低温电子显微镜(cryoo - em)已成为一种广泛用于测定蛋白质和大分子复合物结构的工具。为获得单粒子低温电子显微镜重建的输入,研究了低温电子显微镜的工作原理。

    作者:京荣张,紫王王,余辰,人民韩,志勇刘,飞孙和法章

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 41

    内容类型:方法文章

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  10. 图像分割和定量是定量蜂窝分析中的基本步骤。在这项工作中,我们提供了一种快速,可定制和无监督的细胞分段方法,该方法完全基于Fij ...

    作者:Mischa Schwendy,Ronald E. Unger,Mischa Bonn和Sapun H. Parekh

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 39

    内容类型:方法文章

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  11. 许多医学成像技术利用拟合方法进行定量参数估计和分析。常见的例子是动态对比增强(DCE)磁共振中的药代动力学建模......

    作者:Charlotte Debus, Ralf floa, Michael Ingrisch, Ina Kompan, Klaus maie - hein, Amir Abdollahi和Marco Nolden

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 31

    内容类型:软件

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  12. 单分子定位显微镜是一种超分辨率显微镜技术,允许在纳米尺度上测定生物样品中蛋白质的定位和组织。生物……

    作者:Maarten W. Paul,H.Martijn de Gruiter,Zhanmin Lin,Willy M. Baarends,Wiggert A. Van Cappellen,Adriaan B. Houtsmuller和Johan A. Slotman

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 30

    内容类型:软件

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  13. 计算生物学需要阅读和理解生物数据文件。纯文本格式,如SAM,VCF,GTF,PDB和FASTA,通常包含DAT的关键信息......

    作者:Artem Babaian, Anicet eou, Alyssa Fegen, Ho Yin Kam, German E. Novakovsky, Jasper Wong, Dylan Aïssi和Li Yao

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19.:303

    内容类型:软件

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  14. 连续块面扫描电子显微镜(SBFEM)正在成为神经科学领域的一种流行技术。在过去的几年里,我们看到了越来越多的作品来解决细胞分割的问题。

    作者:Kendrick Cetina, José M. Buenaposada和Luis Baumela

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19.: 298

    内容类型:方法文章

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  15. 原子力显微力曲线的收集和分析是一种熟悉的过程,以获得来自任何类型的样本的非地形数据的高分辨率信息,包括生物学......

    作者:西蒙娜·迪纳雷利,马克·吉拉索和乔瓦尼·朗戈

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19.: 258

    内容类型:软件

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  16. 利用人工智能,特别是深度学习,对组织病理学的计算机视觉越来越感兴趣。虽然积累研究突出了Convoluti的专家级表现......

    作者:Kevin Faust,Quin Xie,Dominick Han,Kartikay Goyle,Zoya Volynskaya,Ugljesa Djuric和Phedias Diamandis

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19.: 173

    内容类型:方法文章

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  17. 斑马鱼是一种广泛使用的模型生物,用于研究心脏发育和心脏病有关的发病机制。在没有幼虫阶段的情况下幸存的能力,强大的遗传Simila ......

    作者:康家炳、杜鸿志、傅子芳、吴志明、朱伯勋及张天豪

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19.: 169

    内容类型:方法文章

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  18. 在过去的二十年中,组合多组织和DNA微阵列概念的组织微阵列(TMA)的创新技术已被广泛应用于组织学领域。它由一个col组成......

    作者:阮浩南,文森特·帕文,西里尔·科乔斯和查尔斯·克夫兰

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19.: 148

    内容类型:方法文章

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  19. 形态学特征广泛用于神经元功能和病理学研究。无脊椎动物神经元通常是结构性陈规定型的,显示出毛空间特征的几乎方差,但较大

    作者:Ajayrama Kumaraswamy,Kazuki Kai,Hiroyuki Ai,Hidetoshi Ikeno和Thomas Wachtler

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19.: 143

    内容类型:方法文章

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  20. 在许多恶性肿瘤中,病理性血管生成被认为是一个潜在的预后因素和治疗靶点。在大多数情况下,血管生成分析是基于微血管密度的测量…

    作者:Faliu yi,林阳,施丹王,雷国,成龙黄,杨谢和广黄肖

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19.: 64

    内容类型:研究文章

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  21. ImageJ是一种在生物科学和超越中广泛使用的图像分析程序。由于其易于使用,可录制的宏观语言和可扩展的插件架构,Imagej享有贡献...

    作者:Curtis T. Rueden, Johannes Schindelin, Mark C. Hiner, Barry E. DeZonia, Alison E. Walter, Ellen T. Arena和Kevin W. Eliceiri

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.:529

    内容类型:软件

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  22. 细胞-支架接触测量来自染色细胞和三种类型的支架(即....)的成对共注册体积荧光共聚焦激光扫描显微镜(CLSM)图像(z-stacks)

    作者:Peter Bajcsy, Soweon Yoon, Stephen J. Florczyk, Nathan A. Hotaling, Mylene Simon, Piotr M. szczpinski, Nicholas J. Schaub, Carl G. Simon Jr, Mary Brady和Ram D. Sriram

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.:526

    内容类型:研究文章

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  23. 脑疾病是人类死亡的最大原因之一。一般来说,神经根学家分析脑医学图像进行诊断。在图像分析领域中,角落是最重要的功能之一,......

    作者:林林高,海威潘,清李,小琴谢,张强张,金明汉和小寨

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.:505

    内容类型:研究文章

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  24. 老化的特征在于逐渐崩溃的细胞结构。核异常是人类普拉杰的标志。依赖年龄核形态变化分析Caenorhabditis elegans.是阿…

    作者:赵梦弟,安杰,李海文,张嘉志,李尚彤,李雪梅,董梦秋,毛恒,陶路易

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.:412

    内容类型:研究文章

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  25. 随着生物研究中产生的数据量不断增加,科学家们需要有效的数据分析方法。聚类分析是一种结合结果可视化的方法。

    作者:迈克尔·克恩,亚历山大·莱克斯,尼尔斯·格伦伯格和克里斯·r·约翰逊

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.:406.

    内容类型:软件

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  26. 牵引力显微镜(TFM)是一种广泛的技术,用于估计细胞在周围基底上施加的诉讼。为了恢复诉讼,有必要解决一个逆问题,我......

    作者:Alejandro Suñé-Auñón, Alvaro Jorge-Peñas, Rocío Aguilar-Cuenca, Miguel Vicente-Manzanares, Hans Van Oosterwyck和Arrate Muñoz-Barrutia

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.: 365

    内容类型:研究文章

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  27. 组织病理学图像对于医学诊断(如癌症及其治疗)至关重要。一个标准的组织病理学切片可以很容易地以高分辨率扫描,比如200,000×200,000像素。这些高…

    作者:徐艳,李烨树,沈正阳,吴紫薇,高腾,范玉波,赖茂德,常义超

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.: 360

    内容类型:研究文章

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  28. 黑腹果蝇是在许多生物学研究领域使用的重要生物,如遗传和发育生物学。果蝇翅膀已被广泛用于研究......

    作者:盛阳迈克尔湖,Yoshitaka Ogawa,Sara Kawana,Koichiro Tamura和Hwee Kuan Lee

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.: 319

    内容类型:软件

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  29. 组织病理学图像分析是识别和诊断癌症的金标准。组织病理学图像的自动分析有助于病理学家对肿瘤及肿瘤亚型的诊断,减轻工作负担。

    作者:闫旭,朱力嘉,梁博王,玉清艾,方章,陶赖和埃里克I-Chao Chang

    引用:欧宝娱乐合法吗2017年18.: 281

    内容类型:方法文章

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