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比较基因组学

由Graziano Pesole编辑

本节包括比较基因组分析的所有方面,包括但不限于:比较系统发育和基因组数据分析的方法和应用。

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  1. 宏基因组学作为确定农业管理做法如何影响人类和动物健康的有力工具,特别是在可能促进蚂蚁的传播方面,正受到越来越多的关注。

    作者:Liang Xiao, Kyle Akers, Ishi Keenum, Lauren Wind, Suraj Gupta, Chaoqi Chen, Reem Aldaihani, Amy Pruden, Liqing Zhang, Katharine F. Knowlton, Xia Kang and Lenwood S. Heath

    引用:欧宝娱乐合法吗202122:117

    内容类型:软件

    发表于:

  2. 基准测试复杂分析管道的性能是开发实验室开发测试(LDT)的重要组成部分。在瓶子(GIAB)Consortiu中的基因组发布的参考样本和基准呼叫......

    作者:Vandhana Krishnan, Sowmithri Utiramerur, Zena Ng, Somalee Datta, Michael P. Snyder和Euan A. Ashley

    引用:欧宝娱乐合法吗202122: 85

    内容类型:方法论的文章

    发表于:

  3. 长度非编码RNA表示具有两个共同特征的大类转录物:它们超过200nt的任意长度阈值,并假设不编码蛋白质。虽然evide的生长身体......

    作者:Oleksii Bryzghalov, Izabela Makałowska和Michał Wojciech Szcześniak

    引用:欧宝娱乐合法吗202122: 59

    内容类型:软件

    发表于:

  4. 连锁不平衡(LD)分析被广泛应用于遗传学,以了解进化和人口统计的历史,并帮助遗传学家确定与感兴趣的遗传性状相关的基因,如……

    作者:唐友、李卓、王超、刘玉新、于鹤龙、王敖学、周耀

    引用:欧宝娱乐合法吗202021:461

    内容类型:软件

    发表于:

  5. 评估多个OMIC数据之间的关联的问题,包括基因组学和代谢组合数据,以识别潜在预测复杂疾病的生物标志物已经获得了相当大的研究我......

    作者:Haileab Hilafu, Sandra E. Safo和Lillian Haine

    引用:欧宝娱乐合法吗202021:283

    内容类型:方法论的文章

    发表于:

  6. 塑性基因组通常显示圆形的四胞胎结构,其具有两个倒置的重复区域,这挑战自动组装程序。Plastid Genomes的正确组装是先决条件......

    作者:Michael Gruenstaeudl和Nils Jenke

    引用:欧宝娱乐合法吗202021:207

    内容类型:软件

    发表于:

  7. 基因的进化史作为当代生物学的基石。哺乳动物基因组中最保守的序列不会为蛋白质编码,产生需要推断序列的进化史......

    作者:坤高和乔纳森米勒

    引用:欧宝娱乐合法吗202021: 48

    内容类型:方法论的文章

    发表于:

  8. 复制-转移-损失模型中的最大简约和解是一种广泛应用于分析成对实体(如宿主和寄生虫、共生物种和寄生虫)进化历史的方法。

    作者:罗斯·马沃特和兰·里伯斯金·哈达斯

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.: 612

    内容类型:方法文章

    发表于:

  9. 随着可用的测序数据集的增长,对异构处理数据的分析可以回答日益相关的生物学和临床问题。科学家面临的挑战是如何高效地完成一项工作。

    作者:Luca Nanni,Pietro Pinoli,Ari​​f Canakoglu和Stefano Ceri

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.:560

    内容类型:软件

    发表于:

  10. 途径富集广泛应用于组学数据分析,以获得预先定义的基因亚群、蛋白质和代谢物的功能作用的生物学洞见。大量的方法……

    作者:景马,阿里绍杰和乔治米略宫

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.:546

    内容类型:研究文章

    发表于:

  11. 正常推理通常基于全长蛋白质序列。然而,大多数蛋白质含有独立折叠和重复的区域,结构域。蛋白质的域架构对它至关重要......

    作者:Emma Persson, Mateusz Kaduk, Sofia K. Forslund和Erik L. L. Sonnhammer

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.:523

    内容类型:研究文章

    发表于:

  12. 随着每一个新的基因组被测序,成千上万的特定物种的基因(孤儿)被发现,一些来自于现有基因的超快速突变,其他许多来自于非基因突变。

    作者:Zebulun Arendsee, Jing Li, Urminder Singh, Priyanka Bhandary, Arun Seetharam和Eve Syrkin Wurtele

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.:440

    内容类型:软件

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  13. 由于在组织、提取和分析相关数据方面存在重大障碍,创建一个可伸缩的计算基础设施来分析数据存储库中包含的丰富信息是困难的。

    作者:Hamid Bagheri, Usha Muppirala, Rick E. Masonbrink, Andrew J. Severin和Hridesh Rajan

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.:436

    内容类型:研究文章

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  14. 数量染色体变异是恶性细胞群的一个标志。识别促进数字染色体变异的因素对理解致癌机制很重要……

    作者:Daniel G. Piqué, Grasiella A. Andriani, Elaine Maggi, Samuel E. Zimmerman, John M. Greally, Cristina Montagna和Jessica C. Mar

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.:336.

    内容类型:软件

    发表于:

  15. 生物信息学资源管理器(BRM)是一个基于Web的工具,用于促进标识符转换和数据集成HOMO SAPIENS.(人类),亩肌肉(鼠标),rattus norvegicus.(老鼠)Danio Reri ......

    作者:Joseph Brown,Aaron R. Phillips,David A. Lewis,Michael-Andres Mans,Yvonne Chang,Robert L.Tanguay,Elena S.Peterson,Katrina M. Waters和Susan C. Dilton

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.: 255

    内容类型:数据库

    发表于:

  16. Log-Linear和多项式建模提供了一种灵活的遗传关联分析,基于来自各种儿童彼此的基因型数据,提供了后代(儿童),父母级和母体效果的遗传关联分析框架......

    作者:Miriam Gjerdevik, Astanand Jugessur, Øystein A. Haaland, Julia Romanowska, Rolv T. Lie, Heather J. Cordell和Håkon K. Gjessing

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.: 165

    内容类型:软件

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  17. 遗传结构变异是众多表型的基础,对一系列生物学结果具有重要意义。尽管它们的重要作用,结构变体(SVs)经常被忽视…

    作者:Matt Ravenhall,Susana Campino和Taane G. Clark

    引用:欧宝娱乐合法吗201920.: 136

    内容类型:软件

    发表于:

  18. 转录因子结合位点(TFBs)损失,增益和调节内容内的损失和重新洗脱,可以改变该调节元件的功能。一些变化对......

    作者:马里奥·弗洛雷斯和伊万·奥夫查伦科

    引用:欧宝娱乐合法吗201819:316.

    内容类型:研究文章

    发表于:

  19. 来自独立克隆或siRNA屏幕的命中的再现性差。这部分是由于数据标准化主要针对独立屏幕内的技术变异性,而不是技术D ...

    作者:Costa Bachas, Jasmina Hodzic, Johannes C. van der Mijn, Chantal Stoepker, Henk M. W. Verheul, Rob M. F. Wolthuis, Emanuela Felley-Bosco, Wessel N. van Wieringen, Victor W. van Beusechem, Ruud H. Brakenhoff和Renée X. de Menezes

    引用:欧宝娱乐合法吗201819:301

    内容类型:方法论的文章

    发表于:

  20. 空间染色质相互作用的变化现在正成为一种协调基因表达调控的统一机制。Hi-C测序技术允许深入了解染色质相互作用的ge…

    作者:约翰·c·斯坦斯菲尔德(John C. Stansfield)、克雷斯韦尔(Kellen G. Cresswell)、弗拉基米尔·i·弗拉基米罗夫(Vladimir I. Vladimirov)和米哈伊尔·g·Dozmorov

    引用:欧宝娱乐合法吗201819: 279

    内容类型:软件

    发表于:

  21. 什么是健康的微生物组?追求这一和许多相关问题,特别是在广泛的疾病中最近公认的微生物组分引发了Metagenomic S的激增。

    作者:迈·欧达和安德烈亚斯·亨舍尔

    引用:欧宝娱乐合法吗201819:227

    内容类型:方法论的文章

    发表于:

  22. 为了研究两个单同位素循环基因组之间的差异,例如线粒体基因组,在串联复制随机损失(TDRL)重新排列下,重要的是考虑整套锅......

    作者:汤姆哈特曼,马蒂亚斯伯恩斯和马丁Middendorf

    引用:欧宝娱乐合法吗201819: 192

    内容类型:软件

    发表于:

  23. 在系统发育重建中,结果是叶片的一棵树,内部节点是假设的祖先。在活力发作中,祖传和生活的分类群可能共存,导致一棵树......

    作者:Guilherme P. Telles, Graziela S. Araújo, Maria E. M. T. Walter, Marcelo M. Brigido和Nalvo F. Almeida

    引用:欧宝娱乐合法吗201819: 172

    内容类型:方法

    发表于:

  24. 常规生产跨越生命领域的基因组大会。新基因组的初步分析通常包括注释和比较基因组学。Synteny提供了一个保守的框架......

    作者:刘dang, Martin Hunt和sheng J Tsai

    引用:欧宝娱乐合法吗201819: 26

    内容类型:研究文章

    发表于:

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