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结构分析

部分由Lukasz Kurgan编辑

本节包括结构分析的所有方面,包括但不限于:生物结构分析的方法和应用,蛋白质结构和生物物理分析,以及基于结构的药物设计。

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  1. 统计潜力,也命名为基于知识的潜力,是从经验数据得出的函数,可用于评估蛋白质折叠和蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)的质量......

    作者:Joaquim Aguirre-Plans, Alberto Meseguer, Ruben Molina-Fernandez, Manuel Alejandro Marín-López, Gaurav Jumde, Kevin Casanova, Jaume Bonet, Oriol Fornes, Narcis Fernandez-Fuentes和Baldo Oliva

    引用:欧宝娱乐合法吗2021.22:4

    内容类型:软件

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  2. 蛋白质 - 肽相互作用在各种生物过程中起着基本作用,例如细胞信号传导,调节网络,免疫应答和酶抑制。肽的特征是......

    作者:Pedro M. Martins, Lucianna H. Santos, Diego Mariano, Felippe C. Queiroz, Luana L. Bastos, Isabela de S. Gomes, Pedro H. C. Fischer, Rafael E. O. Rocha, Sabrina A. Silveira, Leonardo H. F. de Lima, Mariana T. Q. de Magalhães, Maria G. A. Oliveira and Raquel C. de Melo-Minardi

    引用:欧宝娱乐合法吗2021.22: 1

    内容类型:数据库

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  3. 蛋白酶是许多生物过程的关键驱动因素,部分原因是它们对底物的特异性。然而,根据家族和分子功能的不同,它们也可以显示底物促蛋白。

    作者:罗德里戈·奥乔亚,米哈伊尔·马格尼托夫,罗曼·a·拉斯科夫斯基,皮拉尔·科西奥和珍妮特·m·桑顿

    引用:欧宝娱乐合法吗2020.21: 586

    内容类型:方法论的文章

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  4. 代谢组学数据分析依赖于生物信息学工具的使用。许多集成的多功能工具已被开发用于非靶向代谢组学数据的处理,并得到了广泛的应用。更多交错的…

    作者:梁丹丹,刘权,周克军,贾伟,谢国祥,陈天禄

    引用:欧宝娱乐合法吗2020.21:444.

    内容类型:软件

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  5. 蛋白质工程在工业上有许多应用,如开发新药物、疫苗、治疗疗法、食品和生物燃料生产。一种常见的改造蛋白质的方法是进行变异…

    作者:José Renato M. S. Barroso, Diego Mariano, Sandro R. Dias, Rafael E. O. Rocha, Lucianna H. Santos, Ronaldo A. P. Nagem and Raquel C. de Melo-Minardi

    引用:欧宝娱乐合法吗2020.21:275

    内容类型:软件

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  6. 该研究具有以下三种考虑因素:a)跨膜(Tm)蛋白的物理化学性质与球状蛋白质明显不同,需要开头......

    作者:PeterHönigschmid,斯蒂芬布雷姆,Martina Weigl和Dmitrij Frishman

    引用:欧宝娱乐合法吗2020.21: 242

    内容类型:方法论的文章

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  7. 蛋白质重复可以混淆序列分析,因为它们的氨基酸序列的重复性导致识别类似的重复是由于收敛或发散的进化的困难。

    作者:Matthew Merski,KrzysztofMłynarczyk,Jan Ludwiczak,Jakub Skrzeczkowski,StanisławDunin-Horrawicz和MariaW.Górna

    引用:欧宝娱乐合法吗2020.21: 179

    内容类型:研究文章

    发表于:

  8. 蛋白质三级结构预测模型的质量评价是蛋白质结构预测中面临的主要挑战,是蛋白质结构预测的关键。

    作者:欧阳建全,黄宁桥,蒋云琪

    引用:欧宝娱乐合法吗2020.21: 157

    内容类型:方法论的文章

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  9. 染色体的空间结构对各种细胞过程是至关重要的,特别是基因调控,而与结构相关的改变,如易位和基因融合,往往是癌症的关键。

    作者:Mark R. Segal和Kipper Fletez-Brant

    引用:欧宝娱乐合法吗2020.21:73

    内容类型:研究文章

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  10. 四联体是发生在端粒和转录调控区域的特定结构基元。最近的发现证实了它们在生物医学中的重要性,并导致了对它们的进一步检验。

    作者:Tomasz Zok,Mariusz Popenda和Marta Szachniuk

    引用:欧宝娱乐合法吗2020.21: 40

    内容类型:软件

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  11. 计算方法提供鉴定蛋白质AGS的表位,以帮助表征由高通量基因组或蛋白质组学实验鉴定的潜在生物标志物。Pepop版本1.0是...

    作者:Vincent Demolombe,Alexandre G. de Brevern,Franck Molina,GéraldineLavigne,Claude Granier和Violaine Moreau

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:738

    内容类型:方法论的文章

    发表于:

  12. 激酶口袋结构信息对于发现靶向癌症或其他疾病的药物非常重要。虽然目前已经建立了一些激酶序列、结构或药物数据库,但这些数据库还不能完全建立。

    作者:惠文王,嘉迪秋,浩泉刘,英旭,雅佳和云杰赵

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:617

    内容类型:数据库

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  13. 准确预测蛋白质的残基接触对计算蛋白质的三级结构具有重要意义。残基间的协同进化事件分析已被证明是推断残基间进化事件的有效方法。

    作者:海沧张,齐章,福孔菊,建威朱,玉娟高,紫薇谢,明华邓,石威,魏某郑和东博

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:537

    内容类型:方法文章

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    纠正本文已发表于欧宝娱乐合法吗2019年20.:616

  14. 碳水化合物是一类大型和多样的生物分子,从一个简单的单糖到大的多分支聚糖结构。碳水化合物与a的氮原子的共价连接......

    作者:Thomas Lemmin和Cinque Soto

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:513

    内容类型:软件

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  15. 众所周知,第三核苷酸 - 核苷酸相互作用对于确定RNA结构和功能是必不可少的。目前,直接耦合分析(DCA)Infers在序列中的核苷酸接触......

    作者:叶仁剑,小山王,杰迪邱,惠文王,志家刘,云杰赵和陈渡

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:497

    内容类型:研究文章

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  16. 精确表位预测工具的发展对于促进疾病诊断,治疗和疫苗发育是重要的。使用抗体和TCR序列的新方法的出现......

    作者:Swapnil Mahajan, Yan Zhen, Martin Closter Jespersen, Kamilla Kjærgaard Jensen, Paolo Marcatili, Morten Nielsen, Alessandro Sette和Bjoern Peters

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:490

    内容类型:方法论的文章

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  17. 生物信息学方法有助于识别用于诊断或治疗应用的新分子。例如,能够模仿粘合部位的肽的使用在更换...中有几个好处

    作者:Vincent Demolombe,Alexandre G. de Brevern,Liza Felicori,Christophe Nguyen,Ricardo Andrez Machado de Avila,Lionel Valera,BénédicteJardin-Watelet,GénraldineLavigne,AurélienLebreton,Franck Molina和Violaine Moreau

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:387.

    内容类型:方法论的文章

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  18. RNA一级结构,或序列,是一条单链,被认为是一条核苷酸链,从字母表AUGC(腺嘌呤,尿嘧啶,鸟嘌呤,胞嘧啶)。这条线可以折叠到自己身上,也就是一个节段。

    作者:Marek Palkowski和Wlodzimierz Bielecki

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.:208

    内容类型:研究文章

    发表于:

  19. 长期非编码RNA(LNCRNA)在调节基因表达方面发挥着重要作用,因此对于确定表型来说是重要的。大多数时候在LNCRNA中测量选择的尝试都集中在主要......

    作者:Maria Beatriz Walter Costa,ChristianHönerZuSiederdissen,MarkoDunjić,彼得F. Stadler和Katja Novick

    引用:欧宝娱乐合法吗2019年20.: 151

    内容类型:研究文章

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  20. 真核细胞内的DNA围绕组蛋白包裹,形成11nm染色质纤维,其可以进一步折叠成高阶DNA环,这可能取决于建筑因素的结合。预测如何......

    作者:PauFarré,亚历山大Heurteau,Olivier Cuvier和Eldon的偶然

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19:372.

    内容类型:研究文章

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  21. 随着分子生物学正在创造越来越多的序列和结构数据,大量的软件来分析这些数据也在增加。大多数程序是为特定的任务制作的,因此……

    作者:帕特里克·昆兹曼和凯·哈马赫

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19: 346

    内容类型:软件

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  22. 随着兴趣的兴趣从头开始蛋白质设计,有一种愿望就是能够充分探索插入和删除的设计空间。自然插入和删除残留物,优化能源和功能…

    作者:William F. Hooper, Benjamin D. Walcott, Xing Wang和Christopher Bystroff

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19: 337

    内容类型:方法论的文章

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  23. 近几十年来,从蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPINs)中检测蛋白质复合物(PCs)已成为一个活跃的研究领域。目前有大量优秀的图聚类方法,可以有效地提高图的聚类效率。

    作者:荣泉王,桂花刘,蔡泽王,凌涛苏和溧阳太阳

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19:305

    内容类型:方法论的文章

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  24. 三维(3D)基因组空间组织对许多细胞功能至关重要,包括转录,而某些构象驱动的结构改变经常是致癌的。染色体组…

    作者:Mark R. Segal和Henrik L. Bengtsson

    引用:欧宝娱乐合法吗2018年19:196

    内容类型:研究文章

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